二零一二年五月，阿里巴巴集团发出一份公开信，首次披露了旗下淘宝体系中首批因不正当行为而被永久关店并进入司法程序的网商名单。
在公开信中，阿里集团称，已有部分网商因和个别淘宝店小二个人间存在不正当利益往来，已被警方刑拘或采取强制措施。同时，阿里集团呼吁网商共同监督和打击不正当利益收受的行为，共同捍卫淘宝的诚信体系，目前的动作只是开始，淘宝将会继续严厉打击。
根据阿里集团对外公布的情况，因涉嫌“非国家工作人员受贿罪”，前聚划算小二柴某、孔某等三人，已于今年四月被检察院正式批捕，孔某早在去年一十二零一六月即被辞退，另有前聚划算小二李某等二人，也被警方刑事拘留，案件调查正在进行中。
这是三月份“聚划算”地震和阿里集团内大轮岗的后续。当时，聚划算被查出存在员工参与谋取不当利益，数名员工被开除，前总经理阎利珉被直接解职。
随后，阿里集团内部启动了规模空前的大轮岗，22名中高层管理干部涉及其中，调动跨越阿里集团旗下全部子公司。内部人士称，中层及以下调岗更多，如淘宝众多品类负责人轮换了岗位。
自去年初的阿里集团b2b业务“欺诈门”开始，阿里集团的内控就在不断强化。
淘宝还首度明确公布了对涉嫌不正当行为网商的处罚处理方式，对于试图通过各种手段谋取不正当利益的会员网商，一经举报或查实，将一律永久关店，并视情况移交司法机关，追究其法律责任。
值得注意的是，与以往不同，如今淘宝处理腐败案的同时，对于触犯刑律的部分，司法力量也开始介入。
熟悉阿里集团的人士说，阿里内部的局部腐败从二零零九年后开始抬头。这一方面是其业务布局进入又一度高速增长期，另一方面也是基于当年阿里集团招入大批新员工，目前员工总数已达25万人以上，使得管理难度进一步提升。
“任何一家企业在员工总数超过2万人后，都会面临巨大的管理内控难题，仅靠强调价值观已难维系，在制度建设方面也必须进一步提升完善。”该人士说，实际上阿里也意识到员工大扩招对价值观体系造成的冲击。
具体到淘宝而言，经过9年时间发展，它已形成一个万亿元的生态链。有业内观察人士说，如此体量，涉及诸多利益，难免有个别人经受不住诱惑；淘宝环境内从业的店家中，也难免会有人存在“走捷径，拉关系”的想法，遏制这种现象，必须内外兼治。
据悉，在去年的淘宝年会上，马云就曾强调，淘宝必须反对官僚，严防腐败。而在今年年初，马云再度在内部讲话中宣布大面积停止招聘。这被解读是为了对冲过快增员对价值观体系形成的稀释风险。
管理体系的强化有着多个层面。在阿里系内部，目前运行着一部《阿里巴巴集团商业行为准则》，其间对财务利益、关联交易甚至接受礼品、款待等都做了详细规定。
同时，数月以来，阿里多位高层先后对本报强调，在资源分配的运营技术层面，阿里将会加快全面设立数据化、透明化的制度，尽可能降低人工干预因素的权重，而这正是从源头遏制腐败滋生的关键。
在具体反腐机制方面，阿里的价值观体系与制度化管理也正在融合协力。在原先的“政委”体系之外，阿里还成立了廉政部，以强化在反腐领域的制度性力量。
廉政部由阿里集团价值观总监蒋芳带领，蒋芳是阿里最初创业团队“十八罗汉”之一，此前阿里b2b“欺诈事件”和淘宝“聚划算事件”即为其领衔调查。阿里内部人士评价说，蒋芳是阿里价值观的坚决守护者，甚至有着近乎“原教旨情怀”，“她是真的把阿里当成自己的家，在调查发现有人贪腐破坏价值观体系时，甚至会气得流泪。”
长期从事民企反腐研究的法律人士颜水江说，从企业反腐制度建设和组织搭建看，阿里集团算是走在了前头。目前民营企业还很少有专门的廉政部门进行反腐，不少企业甚至还没有审计、监督部门。
二零一二年一十一月三十日二十一时五十分一十八秒，阿里巴巴旗下电商平台淘宝天猫的销售总额突破1万亿元。1万亿元销售额，意味着国内电商行业一步跨过了影响其未来发展的分水岭。按照阿里巴巴1万亿销售额估算，国内网络零售占社会消费品零售总额的比例逼近6，而业内专家认为，网购一旦占到社会消费品零售总额5，就会越过临界点，呈现爆发之势，成为改变中国零售业格局的。
二零一三年十月九日，香港财经事务及库务局局长陈家强在立法会上回应，为了保障投资者必须坚持同股同权的原则，香港上市规则规定不能设有双重股权。全球除了纳斯达克证券交易所等个别美股外，其他市场均无b股安排。这意味着，香港监管层已经正式否决了阿里巴巴以“合伙人制度”在香港上市的可能。有专家表示，阿里和资本方这次押的宝，打水漂的可能性极大，未来只能延期或妥协后再赴港上市。
阿里合伙人制度，不同于传统的合伙企业法中的合伙制，也不等同于双重股权架构。在“合伙人”制度中，由合伙人提名董事会的大多数董事人选，而非根据股份的多少分配董事席位。
在阿里巴巴任职满五年的员工可以经现有合伙人推荐，只要现有合伙人同意票数达到75，这些候选者就可以成为新合伙人。
一些行内专家，他们认为，阿里巴巴要求开绿灯的理由并不充分，港交所坚决不同意对阿里法外施恩，将导致阿里只能延期ipo，2013年年底这个窗口期，阿里是赶不上了，这个窗口何时关闭，要看运气，初步测算应在从现在开始到明年上半年之间。
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